Deteksi Kontaminan DNA Babi pada Sampel Penggilingan Daging di Pasar Surya Kota Surabaya Menggunakan Real Time Polymerase Chain Reaction

Penggilingan daging di Pasar Surya Kota Surabaya belum memiliki regulasi yang jelas terkait sertifikasi halal. Para pelaku usaha makanan yang menggunakan olahan babi dan belum memiliki alat penggilingan daging, dikhawatirkan akan menggilingkan dagingnya di pasar tersebut. Sehingga penggilingan daging yang digunakan terkontaminasi dengan sesuatu yang tidak halal. Sebagai umat muslim, halal dan haramnya suatu makanan sangat penting untuk diperhatikan. Penelitian ini betujuan untuk mendeteksi kontaminan DNA babi pada penggilingan daging dengan metode Real Time PCR (qPCR). Hasil isolat DNA dengan kit komersial instagene matrix menghasilkan kemurnian berkisar antara 1,141 hingga 3,296 dan konsentrasi berkisar antara 2,828 µg/ml sampai 42,86 µg/ml, kemudian dilanjutkan dengan amplifikasi qPCR. Amplifikasi qPCR berjalan pada suhu activation step 50oC - 2 menit, initial denaturation step 95oC - 3 menit, denaturation 95oC - 10 detik, annealing-extention 60oC - 1 menit. Primer probe babi yang digunakan menunjukkan adanya kenaikan kurva pada kontrol positif (EPC) dengan nilai Cq 34,00 dan kontrol negatif (NTC) yang tidak teramplifikasi (N/A). Hasil penelitian menunjukkan bahwa 5 dari 30 sampel mengalami kenaikan kurva amplifikasi. Kelima sampel tersebut adalah 14/2; 15/4; 43; 87/2; dan 87/3 dengan nilai Cq berturut-turut 34,82; 38,07; 37,27; 38,02; dan 49,04. Kenaikan kurva amplifikasi tersebut menunjukkan bahwa sampel sejumlah 16,67% positif mengandung DNA babi.

Kata Kunci: Penggilingan daging, DNA babi, Real Time PCR, Sertifikasi halal